Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrig2Q52KR2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrig2Q52KR2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrig2Q52KR2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms