Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccnl1Q52KE7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccnl1Q52KE7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccnl1Q52KE7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccnl1Q52KE7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms