Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1qtnf9Q4ZJN1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms