Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam228bQ497Q6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam228bQ497Q6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam228bQ497Q6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms