Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx25Q3ZT31 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snx25Q3ZT31 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx25Q3ZT31 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.3 ms