Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Samd5Q3V1H9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms