Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc110Q3V125 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc110Q3V125 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms