Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim9Q3V0X1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim9Q3V0X1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim9Q3V0X1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim9Q3V0X1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim9Q3V0X1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim9Q3V0X1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim9Q3V0X1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim9Q3V0X1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim9Q3V0X1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim9Q3V0X1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim9Q3V0X1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim9Q3V0X1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim9Q3V0X1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms