Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc43Q3V0L5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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