Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd53Q3V0J4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms