Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrfip1Q3UZ39 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrfip1Q3UZ39 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms