Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc114Q3UX62 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc114Q3UX62 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms