Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slfn4Q3UV66 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Slfn4Q3UV66 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Slfn4Q3UV66 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms