Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trat1Q3UU67 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trat1Q3UU67 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms