Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chpf2Q3UU43 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chpf2Q3UU43 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chpf2Q3UU43 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chpf2Q3UU43 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms