Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ScimpQ3UU41 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ScimpQ3UU41 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms