Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdkl5Q3UTQ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkl5Q3UTQ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl5Q3UTQ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl5Q3UTQ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl5Q3UTQ8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl5Q3UTQ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl5Q3UTQ8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl5Q3UTQ8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl5Q3UTQ8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl5Q3UTQ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl5Q3UTQ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl5Q3UTQ8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms