Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc38a11Q3USY0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc38a11Q3USY0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms