Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B3gnt6Q3USF0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms