Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mindy4Q3UQI9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mindy4Q3UQI9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms