Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms