Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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