Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prrc1Q3UPH1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prrc1Q3UPH1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms