Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Q3UPC7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Q3UPC7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UPC7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q3UPC7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Q3UPC7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Q3UPC7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UPC7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3UPC7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q3UPC7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Q3UPC7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3UPC7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3UPC7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3UPC7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3UPC7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3UPC7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q3UPC7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q3UPC7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms