Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Skap2Q3UND0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Skap2Q3UND0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms