Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem253Q3UNB8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem253Q3UNB8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms