Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch2Q3UMG5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrch2Q3UMG5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms