Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cobll1Q3UMF0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms