Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uspl1Q3ULM6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Uspl1Q3ULM6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uspl1Q3ULM6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uspl1Q3ULM6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms