Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pcgf5Q3UK78 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcgf5Q3UK78 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcgf5Q3UK78 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms