Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc61Q3UJV1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc61Q3UJV1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms