Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnep1r1Q3UJ81 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnep1r1Q3UJ81 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms