Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dtx3lQ3UIR3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dtx3lQ3UIR3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dtx3lQ3UIR3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dtx3lQ3UIR3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dtx3lQ3UIR3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dtx3lQ3UIR3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dtx3lQ3UIR3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dtx3lQ3UIR3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dtx3lQ3UIR3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms