Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Greb1Q3UHK3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Greb1Q3UHK3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Greb1Q3UHK3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms