Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zswim8Q3UHH1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zswim8Q3UHH1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zswim8Q3UHH1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms