Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx27Q3UHD6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx27Q3UHD6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx27Q3UHD6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.1 ms