Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem109Q3UBX0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem109Q3UBX0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem109Q3UBX0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms