Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hectd3Q3U487 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hectd3Q3U487 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms