Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam117bQ3U3E2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam117bQ3U3E2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam117bQ3U3E2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam117bQ3U3E2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms