Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hvcn1Q3U2S8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hvcn1Q3U2S8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hvcn1Q3U2S8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hvcn1Q3U2S8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hvcn1Q3U2S8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hvcn1Q3U2S8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hvcn1Q3U2S8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hvcn1Q3U2S8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hvcn1Q3U2S8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms