Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tatdn3Q3U1C6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tatdn3Q3U1C6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms