Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem35bQ3U0Y2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem35bQ3U0Y2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms