Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KhsrpQ3U0V1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KhsrpQ3U0V1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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