Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc9Q3U0M1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trappc9Q3U0M1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc9Q3U0M1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms