Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim6Q3U0I6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms