Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hhla1Q3TYV2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms