Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnnm2Q3TWN3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnnm2Q3TWN3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms