Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21440Q3TTD8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21440Q3TTD8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms