Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc102aQ3TMW1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms