Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Smarca4Q3TKT4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Smarca4Q3TKT4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Smarca4Q3TKT4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Smarca4Q3TKT4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms